Apakah vaginitis bakterialis dapat mempengaruhi perkembangan janin tergantung pada tingkat keparahan vaginitis dan pengobatannya. Kasus ringan vaginitis bakterialis, bila diobati segera, mungkin tidak berpengaruh pada perkembangan janin jika bakteri tidak menginfeksi rahim dan lesi tidak melibatkan rahim. Namun, jika peradangannya parah dan tidak segera diobati, dan bakteri menginfeksi serviks, tubuh rahim atau bahkan memasuki cairan ketuban, perkembangan janin dapat terpengaruh. Ketika infeksi hulu terjadi, wanita hamil lebih mungkin mengalami ketuban pecah dini, pre-eklampsia, keguguran, infeksi intrauterin, dan janin mungkin memiliki pertumbuhan intrauterin yang terbatas atau bahkan berhenti. Ketika bakteri menyerang selaput korionik dan ketuban, hal ini dapat menyebabkan korioamnionitis dan amnionitis, meningkatkan risiko pecahnya selaput ketuban sebelum waktunya, sehingga kelahiran prematur. Vaginitis bakteri selama kehamilan juga meningkatkan risiko infeksi neonatal dan penyakit kuning, yang merupakan ancaman langsung terhadap kesehatan bayi baru lahir. Wanita hamil harus mencari nasihat medis untuk mengidentifikasi penyebab penyakit mereka dan memilih obat yang akan memiliki dampak paling kecil pada bayi.