Ada banyak penyebab neutropenia, tetapi yang paling umum adalah obat-obatan, radiasi, dan faktor autoimun.
Jumlah neutrofil biasanya dapat dipulihkan setelah menghilangkan penyebabnya dan mengobati gejalanya. Namun, pada neutropenia yang parah, tubuh tidak dapat mengembangkan respons inflamasi yang efektif untuk melawan infeksi dan tingkat kematiannya tinggi.