Penyakit jaringan ikat yang tidak berdiferensiasi memiliki gejala yang relatif ringan dan biasanya tidak mempengaruhi harapan hidup normal pasien. Penyakit ini terutama terlihat pada wanita usia subur dan sering dimulai secara diam-diam, dengan waktu rata-rata antara timbulnya gejala dan presentasi ke dokter dua sampai tiga tahun. Pasien dapat muncul dengan gejala non-spesifik seperti malaise, demam ringan dan pembengkakan kelenjar getah bening, serta manifestasi spesifik seperti artralgia, fenomena Raynaud dan kerusakan kulit mukosa, dan karena jarang melibatkan organ vital seperti hati, ginjal, paru-paru dan sistem saraf pusat, biasanya tidak berdampak pada siklus hidup pasien.