Dahak kuning di tenggorokan di pagi hari, pertama-tama, merupakan tanda peradangan di tenggorokan, yang disebabkan oleh infeksi bakteri. Area yang meradang mengalami kongesti dan oedematous, dan juga terdapat eksudasi, kadang-kadang berupa zat berdarah atau inflamasi. Selain itu, neutrofil atau fagosit dalam tubuh berkumpul di tenggorokan untuk menelan bakteri, yang kemudian melisis dan mengalami nekrosis. Bakteri lisis dan nekrotik serta zat-zat inflamasi ini bercampur menjadi satu untuk membentuk dahak kuning. Pada siang hari, banyak menelan dan juga menelan makanan, dan dahak kuning ini dapat masuk ke saluran pencernaan dengan menelan. Namun, pada malam hari, bahan inflamasi dan bahan nekrotik fagosit ini tetap berada di tenggorokan, sehingga pada pagi hari terjadi batuk dahak kuning dan perlu diobati dengan antibiotik.