Pasien dengan gastroenteritis yang memiliki tinja berair perlu diobati dengan obat anti-infeksi dan anti-diare pada waktu yang tepat. Obat anti diare dapat mencakup kuinolon, levofloksasin, norfloksasin, dll. Ceftazidime, cefminox, cefoperazone, dll. Obat anti diare dapat mencakup montelukast, pil anti diare dan probiotik, seperti kapsul Bacillus subtilis dibacterium, Bacillus licheniformis, Saccharomyces boulardii, dll. Pasien dengan gastroenteritis mungkin juga memiliki gejala lain seperti sakit perut, kembung, mual dan muntah, yang dapat diobati dengan obat tambahan.