Endometriosis adalah masalah ginekologi yang umum, tetapi sebelum penggunaan laparoskopi, tingkat diagnosis pra-operasi tidak melebihi 70% bahkan untuk ginekolog yang berpengalaman dan hanya 20% untuk mereka yang kurang berpengalaman. Dua gejala utama endometriosis adalah dismenorea progresif sekunder, berkurangnya kesuburan atau bahkan kemandulan, dan gejala sekunder lainnya seperti nyeri perut bagian bawah yang tidak teratur atau hubungan seksual yang menyakitkan, kesulitan buang air kecil dan buang air besar yang menyakitkan. Gejala sekunder lainnya termasuk nyeri perut bagian bawah yang tidak teratur atau hubungan seksual yang menyakitkan, dispareunia dan tinja yang menyakitkan. Pada kelompok pasien ini, dokter sering menemukan nodul yang menyakitkan di septum rektum dan massa perekat yang tidak terdefinisi dengan baik di panggul selama pemeriksaan ginekologi. Meskipun pasien dengan endometriosis sering kali memiliki gejala dan tanda yang khas, namun ada banyak pasien yang gejalanya tidak persis paralel dengan kondisinya, misalnya mereka yang memiliki tumor besar belum tentu mengalami dismenorea, dan mereka yang mengalami dismenorea berat belum tentu memiliki implan endometrium ektopik yang luas. Adhesi dan nyeri tekan akibat endometriosis sering disalahartikan sebagai tuberkulosis pelvis dan penyakit radang pelvis kronis; nodul endometriotik pada fossa rektum uterus kadang-kadang tidak mudah dibedakan dari nodul kanker ovarium. Beberapa kista cokelat aktif sering dikacaukan dengan teratoma ovarium yang matang, dan ketika kista berada di dekat rahim, kista ini dapat disalahartikan sebagai fibroid subplasmik. Namun, pengenalan laparoskopi telah membuat lompatan kuantum dalam diagnosis dini gangguan ektopik. Melalui laparoskopi, para ginekolog dapat secara sistematis memvisualisasikan organ-organ panggul dan permukaan plasmanya, memahami luasnya endometriosis, kedalaman infiltrasi dan derajat adhesi, dan menata penyakit sesuai dengan temuan-temuan ini untuk menentukan tingkat keparahan kondisi dan memandu pengobatan. Pembesaran lesi dapat diubah dengan memvariasikan jarak antara lensa laparoskopi dan lesi. Oleh karena itu, lensa ditempatkan dekat dengan lesi yang mencurigakan selama pemeriksaan dan dapat mengkonfirmasi diagnosis lesi kecil dan awal. Kasus klinis awal tanpa riwayat, tanda dan gejala endometriosis yang khas terutama didiagnosis dan dipentaskan dengan laparoskopi, terutama pada pasien dengan infertilitas yang tidak dapat dijelaskan. Pementasan endometriosis yang sekarang umum dilakukan oleh American Fertility Society didasarkan pada laparoskopi. Pada pasien dengan nyeri panggul kronis yang dicurigai menderita endometriosis, laparoskopi bisa dilakukan untuk menentukan apakah kondisinya adalah endometriosis, penyakit radang panggul kronis, atau stasis panggul. Selain itu, dalam kasus-kasus di mana kista cokelat dicurigai tetapi tidak sepenuhnya pasti, tusukan laparoskopi dapat dilakukan untuk menganalisis sifat cairan kista dan mengangkat jaringan dari dinding kista untuk pemeriksaan patologis untuk memperjelas diagnosis. Pada pasien dengan infertilitas, tes patensi tuba juga dapat dilakukan pada saat yang sama. Pewarna yang tidak berbahaya disuntikkan melalui pembukaan serviks dan patensi tuba falopi diamati langsung di bawah laparoskop. Lesi kemudian diobati sesuai dengan temuan laparoskopi dan pilihan pengobatan lebih lanjut dipilih sesuai dengan karakteristik dan stadium lesi dan urgensi kebutuhan kesuburan. Laparoskopi sekarang semakin banyak digunakan dalam diagnosis dan pengobatan endometriosis karena keuntungannya yaitu cedera minimal dan pemulihan pasca-operasi yang cepat. Untuk fokus ektopik yang kecil atau multipel, berbagai metode seperti laser, elektrokoagulasi dan microwave cautery tersedia di bawah laparoskopi. Untuk kista cokelat yang besar, eksisi kista dapat dilakukan, dengan mempertahankan jaringan ovarium yang normal. Pembedahan semi-radikal atau radikal, seperti ovarium atau bahkan histerektomi, dapat dilakukan pada beberapa kasus endometriosis yang parah dan berulang tanpa persyaratan kesuburan untuk menghindari kekambuhan. Laparoskopi dan pembedahan sekarang merupakan pilihan diagnostik dan pengobatan rutin untuk pasien dengan endometriosis di sebagian besar rumah sakit.