Anak-anak dengan celah langit-langit memiliki kemungkinan lebih tinggi terkena otitis media daripada orang normal, karena ada saluran dari telinga tengah di dalam telinga ke tenggorokan yang disebut tuba eustachius. Tabung eustachius memungkinkan sekresi dari telinga tengah mengalir ke tenggorokan dan menjaga keseimbangan tekanan antara sisi dalam dan luar gendang telinga. Pada pasien celah langit-langit, langit-langit mulut cacat dan otot-otot langit-langit lunak tidak terdistribusi dengan baik, yang membuat pembukaan dan penutupan faring dari tuba eustachius tidak berfungsi dan menciptakan tekanan negatif di telinga tengah, sehingga masalah cairan di telinga tengah (juga dikenal sebagai otitis media eksudatif) sering muncul. Menurut statistik, cairan di telinga tengah merupakan komplikasi umum pada 95% pasien dengan celah langit-langit sekitar usia 1 tahun. Gejala utama cairan di telinga tengah adalah gangguan pendengaran atau perasaan bengkak di telinga. Namun demikian, karena sebagian besar anak kecil tidak mengekspresikan hal ini, orang tua biasanya tidak menyadarinya. Kecuali jika cairan menjadi terinfeksi dan menjadi otitis media supuratif akut, akan ada demam atau keluarnya cairan dari liang telinga. Kadang-kadang anak-anak mungkin menggaruk telinga mereka karena merasa tidak nyaman, jadi penting untuk menyadari adanya masalah telinga. Jika otitis media oozing tidak diobati, gendang telinga akan membekas dan mengeras dari waktu ke waktu. Jika hal ini dikombinasikan dengan otitis media supuratif yang sering terjadi, kerusakan gendang telinga akan menjadi lebih parah dan menyebabkan gangguan pendengaran permanen, yang pada gilirannya akan mempengaruhi perkembangan bicara dan suara yang tidak normal. Ahli THT dapat menggunakan otoskop untuk memeriksa kelainan membran timpani atau melakukan tes pendengaran untuk melihat apakah ada gangguan pendengaran. Timpanogram juga dapat dilakukan untuk mendeteksi lesi telinga tengah awal. Perawatannya konservatif atau dapat dikombinasikan dengan perbaikan celah langit-langit di mana kateter telinga tengah ditempatkan di bawah anestesi umum untuk mendorong drainase plasma atau lendir yang telah terakumulasi di rongga telinga tengah. Dianjurkan untuk menghindari air di saluran telinga setelah operasi untuk menghindari otitis media purulen. Tabung telinga tengah biasanya mengalir secara otomatis dari membran timpani dalam waktu satu tahun, tetapi beberapa orang mungkin mengalami kekambuhan cairan di telinga tengah sebagai akibatnya dan perlu dirawat lagi.