Untuk ulkus aphthous berat dengan riwayat ulkus mulut berulang dan ulkus mulut dalam, infeksi sekunder pada permukaan ulkus harus dicegah; untuk ulkus traumatik, faktor traumatik (misalnya tunggul dan mahkota akar, iritasi oleh restorasi yang buruk) harus dihilangkan; untuk ulkus tuberkulosis, pengobatan anti tuberkulosis sistemik harus diberikan; untuk ulkus mulut tanpa penyebab di atas atau ulkus yang belum mengecil meskipun faktor-faktor penyebabnya sudah dihilangkan, terjadinya kanker mulut harus diwaspadai dan biopsi harus dilakukan sesegera mungkin untuk mengklarifikasi diagnosis dan memberikan pengobatan tepat waktu.