Penyebab menstruasi hitam termasuk kebiasaan gaya hidup yang buruk, seperti tidak menjaga kehangatan selama menstruasi, keinginan untuk kedinginan, makan makanan yang dingin, pedas dan merangsang, pekerjaan yang berlebihan dan stres kehidupan, sembelit kronis, olahraga berat selama menstruasi, seks yang tidak terkendali, diet yang berlebihan dan kecanduan alkohol dan tembakau, semuanya dapat menyebabkan menstruasi hitam.
Selain itu, infeksi genital dan tumor genital juga dapat menyebabkan haid berwarna hitam, biasanya disertai demam, perut kembung dan nyeri perut.
Darah haid yang berwarna gelap setelah operasi caesar mungkin terkait dengan penyembuhan sayatan caesar yang buruk, di mana sayatan membentuk depresi yang rusak pada lapisan otot di mana darah haid dapat terakumulasi dan perlahan-lahan dibuang setelah haid, menghasilkan warna kecoklatan pada darah haid.