Sepsis neonatal terutama merupakan infeksi bakteri: 1. Terapi antimikroba, mengkultur bakteri yang berbeda dan memberikan perawatan yang berbeda. Misalnya, untuk bakteri Gram-positif, pengobatan sering dipilih dari benzocillin, vancomycin, teicoplanin dan svo. Dalam kasus bakteri Gram-negatif, pengobatan sering diberikan dengan antibiotik triple sefalosporin atau ampisilin. 2. Pengobatan suportif, dalam kasus sepsis, dukungan nutrisi diberikan untuk menjaga keseimbangan air-elektrolit dan untuk memperbaiki gangguan keseimbangan asam-basa-nya. 3. Pengobatan suportif, termasuk transfusi neutrofil, infus gammaglobulin intravena, faktor pembekuan, dan pengobatan suportif lainnya. Penanganan sepsis neonatal terutama terdiri atas pengobatan spesifik dan terapi pendukung simtomatik.