Tidak ada laporan dalam literatur bahwa MRI dapat menyebabkan kerusakan atau kecacatan yang signifikan, tetapi dapat menyebabkan ketidaknyamanan ringan selama pemeriksaan. Yang pertama, ruang MRI panjang dan sempit, dan lorongnya yang besar dan bundar, dapat menyebabkan pasien merasa terintimidasi secara psikologis. Yang kedua adalah selama pemeriksaan, instrumen MRI akan mengeluarkan suara yang keras, membuat pasien merasa tidak nyaman atau bahkan tidak nyaman. Selain itu, MRI memiliki efek termal tertentu dan dapat menghasilkan panas, yang juga dapat menyebabkan ketidaknyamanan pada tubuh. Jika pasien memiliki benda bawaan seperti stent vaskular atau alat pacu jantung di dalam tubuhnya, pemeriksaan bisa berbahaya atau bahkan mengancam jiwa. Pasien harus sepenuhnya diberitahu tentang tindakan pencegahan yang harus dilakukan sebelum MRI dilakukan.