Perbedaan utama antara influenza A dan influenza B adalah sebagai berikut.
Patogen yang berbeda: Influenza A disebabkan oleh virus influenza A, yang lebih menular dan menimbulkan epidemi yang hebat dan meluas, dan virus ini lebih rentan terhadap mutasi; Influenza B disebabkan oleh virus influenza B dan sebagian besar merupakan epidemi terbatas.
Tingkat gejala yang berbeda: Keduanya mengalami demam, menggigil, nyeri otot umum, kelemahan, sakit kepala dan pusing, tetapi influenza A lebih parah.
Pengobatan berbeda: pengobatan anti-virus influenza (misalnya oseltamivir, paramivir, dll.) adalah andalan untuk influenza A dan influenza B, tetapi amantadine hanya digunakan untuk influenza A.