Beberapa antibiotik tidak memiliki efek buruk pada janin ketika digunakan dengan benar, tetapi beberapa mungkin memiliki efek toksik pada janin, menyebabkan pertumbuhan janin yang lambat dan, dalam kasus yang parah, malformasi. Antibiotik penisilin dan sefalosporin, yang tidak terlalu toksik dan umumnya tidak teratogenik terhadap janin, dapat digunakan untuk mengobati berbagai infeksi selama kehamilan. Namun, mereka tidak boleh digunakan dalam jumlah besar oleh wanita hamil, dan harus digunakan di bawah bimbingan dokter, dengan tinjauan rutin terhadap pertumbuhan dan perkembangan janin. Makrolida, seperti eritromisin, juga tidak terlalu berbahaya bagi janin dan dapat digunakan oleh wanita hamil yang alergi terhadap penisilin atau sefalosporin, tetapi cobalah untuk tidak menggunakan azitromisin, yang dapat menjadi racun bagi janin melalui plasenta dan dapat merusak janin jika digunakan dengan tidak tepat. Kuinolon, aminoglikosida, tetrasiklin, dan antibiotik sulfa, yang dilarang selama kehamilan, dapat masuk ke dalam janin melalui plasenta dan menyebabkan gangguan perkembangan janin dan malformasi multi-sistem, terutama pada awal kehamilan, dan dapat memiliki efek samping yang serius pada sistem saraf dan perkembangan mata, yang menyebabkan keterbelakangan mental dan gangguan penglihatan pada bayi yang baru lahir. Malformasi janin yang disebabkan oleh obat-obatan sulit untuk disembuhkan, dan bahkan jika mereka dapat dilahirkan, mereka tidak dapat sepenuhnya dipulihkan kesehatannya dan memiliki tingkat kelangsungan hidup yang rendah. Wanita hamil harus segera mencari pertolongan medis segera setelah kelainan janin terdeteksi setelah penggunaan narkoba yang tidak disengaja.