HPV biasanya ditularkan secara seksual melalui kontak genital. Peluang penularan HPV selama hubungan seksual tidak diketahui, tetapi literatur melaporkan bahwa peluangnya sekitar 65% atau lebih tinggi. Demikian pula, sebagian besar penelitian menemukan bahwa 64-70% wanita dengan lesi HPV serviks memiliki pasangan seksual yang dapat mendeteksi lesi HPV pada alat kelamin ketika mereka dites. Lesi ini sangat kecil sehingga orang tersebut mungkin tidak menyadarinya. Biasanya, HPV ditularkan selama hubungan seksual dan dapat berkembang menjadi kutil kelamin dalam jangka waktu sekitar empat minggu hingga delapan bulan, tetapi beberapa infeksi dapat tetap laten dan berkembang menjadi kutil atau lesi serviks bertahun-tahun atau bahkan puluhan tahun kemudian. Jadi, tidak mungkin untuk menentukan secara pasti kapan infeksi HPV terjadi. Ketika salah satu pasangan telah mengembangkan lesi HPV, maka kedua pasangan dalam hubungan seksual dapat terinfeksi satu jenis HPV pada saat yang sama. menggunakan kondom saat berhubungan seks dapat mengurangi paparan virus dan dapat mempercepat pembersihan HPV. Ketika viral load HPV berkurang, sistem kekebalan tubuh Anda dapat membersihkan virus dengan lebih efektif. Seks oral juga merupakan salah satu cara penularan HPV. Namun, penelitian telah menemukan bahwa seperempat dari epitel skuamosa di kepala dan leher berisiko tinggi terkena HPV, jadi meskipun seks oral dapat menyebabkan penularan HPV, namun jarang menyebabkan penyakit yang serius. Selain hubungan seks, kontak tidak langsung, seperti menggunakan toilet, gagang pintu, sabun, kolam renang, dan bak mandi, juga dapat menyebabkan penularan HPV. Inilah sebabnya mengapa HPV ditularkan dengan berbagai cara, bahkan dalam kehidupan sehari-hari. HPV 6 dan 11 dapat ditularkan kepada bayi baru lahir selama persalinan pervaginam, menyebabkan kutil pada saluran pernapasan bagian atas atau ruang tunggu, tetapi hal ini juga jarang terjadi dan operasi caesar dapat mengurangi risiko ini. Jika kutil kelamin telah sembuh selama lebih dari 6 bulan, maka persalinan pervaginam lebih kecil kemungkinannya untuk menularkan HPV.