Meskipun amoksisilin juga merupakan obat penisilin spektrum luas semi-sintetik, namun belum tentu sama dengan penisilin, yaitu alergi terhadap penisilin, dan belum tentu 100% alergi terhadap amoksisilin. Jika tidak ada gejala klinis yang jelas setelah mengkonsumsinya, tidak perlu khawatir, selama seseorang berhati-hati untuk minum lebih banyak air dan mengamati perubahan kondisi. Jika ada sesak dada, kesulitan bernapas, penurunan tekanan darah, wajah pucat, denyut nadi lemah atau bahkan syok, pasien dianggap alergi dan harus segera dikirim ke rumah sakit untuk perawatan, rehidrasi dan pengobatan anti-alergi seperti adrenalin dan glukokortikoid. Dianjurkan untuk melarang meminumnya.