Atresia vagina lengkap sebagian besar disebabkan oleh kelainan perkembangan bawaan, dan rahim pasien sering kali tidak berkembang, sehingga meskipun dengan koreksi bedah vagina, kemungkinan terjadinya pembuahan sangat rendah. Atresia vagina yang tidak sempurna sering disebabkan oleh cedera lahir, obat-obatan korosif, pembedahan atau infeksi yang mengakibatkan kontraktur parut dan penyempitan vagina, dengan hanya lubang kecil di bagian tengahnya, dan posisi atresia yang rendah dapat mempengaruhi kehidupan seksual. Selama kehamilan, bekas luka dapat melunak karena kongesti seiring dengan perkembangan kehamilan. Jika hanya terdapat stenosis melingkar atau semi melingkar yang ringan, bagian preluksasi cincin memiliki efek dilatasi yang terus menerus pada bekas luka melingkar setelah persalinan, yang sering kali dapat mengatasi hambatan ini dan menyelesaikan persalinan. Jika atresia rendah, episiotomi profilaksis unilateral atau bilateral dapat dilakukan, jika diperlukan, untuk mencegah laserasi perineum yang parah. Jika bekas luka luas dan tinggi, persalinan pervaginam merupakan kontraindikasi dan operasi caesar lebih disukai. Gejalanya mirip dengan atresia hymen, dan tidak ada lubang vagina pada pemeriksaan, tetapi permukaan mukosa pada atresia berwarna normal dan tidak menonjol ke arah luar, dan pemeriksaan dubur menunjukkan adanya massa darah vagina yang menonjol ke arah rektum, yang lebih tinggi daripada atresia hymen. Pemeriksaan vagina bersifat diagnostik. Anomali kongenital, cedera lahir, agen korosif, stenosis kontraktur parut yang terbentuk akibat pembedahan atau infeksi. Atresia vagina lengkap paling sering disebabkan oleh kelainan perkembangan bawaan, dan rahim pasien sering kali kurang berkembang, sehingga bahkan dengan koreksi bedah vagina, kemungkinan pembuahan sangat kecil. Atresia vagina yang tidak lengkap sering disebabkan oleh cedera lahir, obat-obatan korosif, pembedahan atau infeksi dan pembentukan penyempitan kontraktur parut, yang hanya menyisakan lubang kecil di bagian tengah, posisi atresia yang rendah dapat mempengaruhi kehidupan seksual. Selama kehamilan, bekas luka dapat melunak karena kongesti seiring dengan perkembangan kehamilan. Jika hanya terdapat stenosis melingkar atau semi melingkar yang ringan, bagian preluksasi cincin memiliki efek dilatasi yang terus menerus pada bekas luka melingkar setelah persalinan, yang sering kali dapat mengatasi hambatan ini dan menyelesaikan persalinan. Jika atresia rendah, episiotomi profilaksis unilateral atau bilateral dapat dilakukan, jika diperlukan, untuk mencegah laserasi perineum yang parah. Jika bekas luka luas dan tinggi, persalinan pervaginam merupakan kontraindikasi dan operasi caesar lebih disukai.