Cegukan refluks asam lambung sepanjang waktu biasanya disebabkan oleh gangguan pencernaan, pola makan yang tidak tepat, refluks esofagitis, dan tukak lambung. Pertama, makanan yang masuk ke dalam lambung perlu dikorosi oleh cairan pencernaan sebelum dapat dipecah dan kemudian dikeluarkan ke duodenum. Begitu gangguan pencernaan terjadi, pencernaan makanan akan terpengaruh dan waktu pengosongan akan relatif lebih lama. Penderita dispepsia tidak hanya mengalami kembung di perut, tetapi juga refluks asam di lambung. Perut yang terlalu tegang juga dapat menyebabkan iritasi pada diafragma, dan beberapa orang mungkin mengalami cegukan sebagai akibatnya. Kedua, makan makanan yang terlalu asam, terlalu pedas atau terlalu manis dapat merangsang sekresi asam lambung yang berlebihan, yang dapat menyebabkan refluks asam. Ketika refluks asam terjadi di lambung, hal ini mempengaruhi fungsi peristaltik lambung dan juga menyebabkan iritasi pada organ-organ di sekitarnya, menyebabkan cegukan. Sekali lagi, refluks asam dapat menyebabkan refluks esofagitis ketika melanggar mukosa kerongkongan, yang dapat disertai dengan refluks asam, bersendawa, rasa terbakar dan nyeri, dan dalam beberapa kasus, cegukan. Akhirnya, ketika ada tukak lambung di lambung, lebih mungkin diserang oleh asam lambung, terutama ketika asam lambung menyentuh permukaan tukak, yang menyebabkan kontraksi spasmodik dinding lambung, dan bahkan merangsang diafragma melalui ligamen diafragma lambung, dan diafragma akan kejang dan berkontraksi ketika distimulasi, mengakibatkan cegukan.