Jawabannya segera terungkap: virus HPV dalam proses infeksi tubuh manusia, umumnya hanya lapisan paling dangkal dari sel selaput lendir kulit, epidermis, bahkan dermis kulit jarang masuk ke dalam tubuh darah bukan virus HPV, pengobatan biasanya didasarkan pada pengobatan lokal, melalui cara pengobatan saat ini, kutil lokal dapat sepenuhnya dihilangkan, beberapa pasien setelah pengobatan HPV juga bisa negatif. Beberapa pasien juga bisa menjadi negatif untuk HPV setelah pengobatan. Secara umum, jika tidak ada kekambuhan, sebagian besar virus dapat dihilangkan secara lokal dalam waktu 3 bulan setelah pengobatan. Dalam waktu sekitar dua tahun setelah pengobatan, 90% sistem kekebalan tubuh pasien akan secara bertahap menghilangkan HPV yang tersisa, dan sangat jarang pasien mengalami infeksi HPV berulang dalam waktu yang lama. Pasien yang sudah lama mengonsumsi obat imunosupresif, misalnya, atau yang menderita diabetes atau AIDS. Pasien-pasien ini mengalami pertempuran yang panjang dan berulang-ulang antara virus HPV dan sistem kekebalan tubuh, tetapi secara umum sistem kekebalan tubuh biasanya mampu menghancurkan virus.