Penyakit tangan, kaki dan mulut biasanya membutuhkan waktu sekitar seminggu untuk sembuh jika bisa disembuhkan hanya dengan minum obat. Sebagian besar orang dengan kasus HFMD yang relatif ringan akan sembuh dari gejalanya dalam waktu seminggu. Tidak diperkirakan bahwa pengobatan dapat secara signifikan memperpendek perjalanan HFMD, karena sebagian besar obat bersifat simtomatik, seperti ibuprofen dan acetaminophen, yang mengurangi demam menjadi normal dan mencegah kejang demam. Pada saat demam, anak akan merasa sangat tidak nyaman dan penggunaan obat-obat ini secara simtomatik terutama untuk membuat anak merasa lebih nyaman dan tidak mengakui bahwa obat-obat ini dapat secara signifikan mempersingkat perjalanan HFMD. Dalam aspek pengobatan Tiongkok ini, penerapan obat-obatan seperti Pan Lan Gen untuk membersihkan panas dan mendetoksifikasi racun kemungkinan akan memiliki efek yang lebih baik pada keseluruhan perjalanan penyakit. Untuk pasien HFMD yang lebih parah, penggunaan obat-obatan seperti glukokortikoid atau imunoglobulin manusia, serta obat-obatan herbal yang membersihkan panas dan mendetoksifikasi api, dapat mengendalikan dan mempersingkat perjalanan penyakit. Dalam kasus HFMD ringan, obat-obatan ini tidak dianggap secara signifikan memperpendek perjalanan penyakit.