Gastroskopi umumnya tidak menimbulkan rasa sakit dan sekarang sebagian besar dilakukan dengan menggunakan gastroskopi tanpa rasa sakit, yang dapat sangat mengurangi ketidaknyamanan pasien selama prosedur. Selama gastroskopi, sebuah selang harus dimasukkan ke dalam tenggorokan dan pasien harus bernapas dengan kuat selama selang dimasukkan untuk menghindari abrasi pada tenggorokan. Jika gastroskopi normal dilakukan, pasien mungkin akan mengalami mual dan muntah selama proses ini. Pasien yang terlalu gugup atau takut dapat memilih gastroskopi tanpa rasa sakit, di mana pasien akan tertidur selama pemeriksaan dan tidak akan merasakan ketidaknyamanan. Selama Anda memilih untuk pergi ke rumah sakit biasa, Anda dapat mempercayai keterampilan dokter dan tidak terlalu merasa tidak nyaman. Pasien dapat mengurangi ketidaknyamanan dengan bekerja sama secara aktif dengan dokter selama gastroskopi atau dengan memikirkan hal lain untuk mengalihkan perhatian mereka. Anda tidak boleh makan atau berolahraga berat 12 jam sebelum gastroskopi dan hindari merokok untuk menghindari iritasi pada area tenggorokan yang dapat memperparah ketidaknyamanan dan membuat hasil tes menjadi lebih akurat.