Durasi moksibusi biasanya ditentukan oleh kondisi pasien dan tidak dapat disamaratakan. Moksibusi dapat digunakan untuk mengobati penyakit, melancarkan peredaran darah, menghilangkan stasis darah, dan menghangatkan tubuh yang kedinginan. Jika moksibusi digunakan untuk perawatan kesehatan umum, sebaiknya tidak terlalu lama, tetapi sekali sehari, selama 20-30 menit setiap kali, dengan area lokal terasa sedikit hangat. Untuk penyakit dengan durasi yang lebih lama, atau penyakit defisiensi dingin, seperti dismenore, diare defisiensi dingin, ankylosing spondylitis, moksibusi sering kali membutuhkan waktu lebih lama, dan moksibusi harus berat, biasanya lebih dari 40 menit, bahkan setelah panas menembus ke dalam tubuh sebelum menghentikan moksibusi. Selain itu, saat moksibusi harus memperhatikan moxa dari tubuh untuk mempertahankan posisi tertentu, jangan terlalu dekat untuk menghindari luka bakar, moksibusi tidak boleh segera setelah moksibusi dengan air dingin untuk mencuci tangan atau mandi, jangan moksibusi dalam waktu satu jam setelah makan, tubuh tampak kedinginan, demam tidak bisa moksibusi.