Prognosis pembesaran jantung biasanya tergantung pada kondisi primer dan luasnya pembesaran jantung, yang terkait dengan luasnya lesi (misalnya area stenosis) dan adanya komplikasi seperti gagal jantung dan aritmia. Pasien dengan sedikit komplikasi, deteksi dini pembesaran jantung dan pengendalian faktor risiko yang efektif, umumnya memiliki prognosis yang lebih baik dengan pengobatan yang agresif. Pasien dengan kardiomiopati dilatasi atau mereka yang mengalami gagal jantung berat atau aritmia, terutama pada orang tua, bayi dan anak-anak dengan resistensi rendah, umumnya memiliki prognosis yang lebih buruk.