Kista fisiologis paling sering ditemukan di rongga panggul dan perut dan memerlukan pembedahan jika ukurannya besar. Jika kista berukuran lebih besar dari 5 cm dan disertai dengan kram perut paroksismal, sifat kista perlu ditentukan terlebih dahulu dan eksplorasi bedah dilakukan untuk melihat apakah kista tersebut jinak atau ganas. Kista fisiologis yang lebih kecil dapat dipantau dan ditinjau setiap 2-3 bulan pada awalnya, dengan rencana pengobatan yang akan dikembangkan pada tahap selanjutnya tergantung pada situasinya. Jika kista tidak berubah dalam 1 bulan dan tidak menyusut atau tumbuh secara signifikan, pada dasarnya kista ini adalah kista fungsional. Jika kista membesar lebih signifikan, diperlukan identifikasi yang cepat mengenai sifat kista. Kista jinak juga harus ditanggapi secara serius karena dapat menyebabkan torsi. Jika ganas, diperlukan operasi pengangkatan segera.