Amoksisilin dapat digunakan untuk pengobatan erosi lambung, tetapi hanya sebagai obat tambahan, tidak boleh digunakan sendiri untuk pengobatan erosi lambung dan perlu digunakan secara khusus di bawah pengawasan dokter spesialis. Penyakit seliaka adalah jenis gastritis kronis, yaitu lesi dengan erosi mukosa lambung di atas gastritis kronis. Hal ini diobati dengan penekan asam yang dikombinasikan dengan obat yang mendorong perbaikan mukosa. Jika pasien mengalami erosi mukosa lambung atau gastritis dan jelas ada infeksi bakteri seperti infeksi H. pylori, pengobatan anti-infeksi dengan amoksisilin dapat ditambahkan, tetapi biasanya antibiotik lain diperlukan untuk eradikasi H. pylori, yang mana harus dikonsultasikan dengan spesialis.