Gangguan ovulasi tidak dapat benar-benar disembuhkan dan prinsip pengobatannya adalah mengobati masalah yang terkait dengan gangguan ovulasi dengan mengendalikannya. Pasien dengan gangguan ovulasi sering dikombinasikan dengan masalah menstruasi atau bahkan perdarahan uterus yang tidak normal dan memerlukan pengobatan yang mempertimbangkan usia pasien, persyaratan kesuburan dan karakteristik menstruasi. Biasanya wanita yang lebih muda, atau wanita dengan fungsi ovarium yang berkurang setelah usia 40 tahun, yang rentan terhadap gangguan ovulasi, dan keduanya diperlakukan secara berbeda. Jika pasien tidak memiliki persyaratan kesuburan, prinsip pengobatan adalah menghentikan pendarahan dan menyesuaikan siklus menstruasi. Jika pasien memiliki persyaratan kesuburan, tujuan utama pengobatan adalah untuk meningkatkan ovulasi, dan ketika ovulasi normal, menstruasi akan menjadi normal. Pada orang dengan gangguan ovulasi, terutama remaja, yang lebih cenderung melihat pasien obesitas, pengobatan untuk menyesuaikan siklus menstruasi dan menghentikan pendarahan perlu disertai dengan modifikasi gaya hidup dan pengobatan penurunan berat badan, yang harus dipertahankan seumur hidup.