Banyak orang yang menderita penyakit usus dan dokter akan merekomendasikan kolonoskopi. Pada kebanyakan kasus, kolonoskopi tidak terlalu tidak nyaman dan dapat ditoleransi. Namun, banyak orang, karena alasan psikologis dan fisik, akan mengalami masalah yang lebih tidak nyaman. Kolonoskop yang digunakan untuk kolonoskopi adalah alat berbentuk tabung dengan diameter tertentu. Kolonoskop harus masuk melalui lubang anus sampai ke daerah ileocecal dan selama proses masuknya alat ini, akan timbul sensasi seperti buang air besar dan terus menerus. Sensasi ini dapat membuat pasien merasa tidak nyaman. Selain itu, selama kolonoskopi, dokter perlu terus-menerus mengembang, mengisi dengan air, menyuntikkan antifoam dan obat lain agar dapat melihat dengan jelas tampilan bagian dalam usus, sehingga terjadi pelebaran usus secara lokal dan operasi ini dapat mengakibatkan rasa kembung. Beberapa orang, misalnya, mungkin merasa ketidaknyamanan ini lebih tidak nyaman. Ketidaknyamanan pasti ada selama pemeriksaan, tetapi tidak ada yang dapat dilakukan untuk mengurangi ketidaknyamanan pasien. Saat ini, kolonoskopi lebih sering dilakukan di bawah anestesi, sebagian besar menggunakan anestesi intravena, di mana obat diberikan secara intravena dan pemeriksaan diawasi secara ketat oleh ahli anestesi, yang tidak hanya aman tetapi juga meminimalkan ketidaknyamanan selama pemeriksaan. Meskipun ada ketidaknyamanan yang terkait dengan kolonoskopi, namun hal ini dapat diatasi dengan kondisi medis yang ada. Bagi mereka yang perlu diperiksa, tetap disarankan untuk segera melakukannya.