Ada banyak jenis esofagitis yang berbeda dan durasi pengobatannya agak bervariasi, dari 1-2 minggu hingga 6-8 minggu atau bahkan lebih lama. Jenis oesofagitis klinis yang paling umum adalah oesofagitis refluks yang disebabkan oleh GERD, selain beberapa oesofagitis mikotik, atau oesofagitis obat dan bahan kimia terbakar. Waktu yang diperlukan untuk mengobati berbagai jenis esofagitis bervariasi, dan salah satu yang lebih sulit diobati secara klinis adalah refluks esofagitis. Umumnya refluks esofagitis memiliki perjalanan yang panjang, kecenderungan kronis dan cenderung kambuh kembali. PPI direkomendasikan setidaknya selama 6-8 minggu bagi mereka yang mengalami erosi dan mungkin perlu dipertahankan selama lebih dari 8 minggu bagi mereka yang tidak mengalami erosi. Pada mycosis oesophagitis, pengobatan klinis memerlukan obat antijamur, yang biasanya memberikan hasil yang baik dalam waktu sekitar 1-2 minggu. Pada esofagitis akibat cedera kimiawi, tingkat kerusakannya bervariasi dan begitu juga dengan perjalanan pengobatannya, yang juga biasanya sekitar 1-2 minggu pada fase akut. Oleh karena itu, durasi pengobatan bervariasi untuk penyebab esofagitis yang berbeda dan harus ditentukan oleh saran medis dan pemeriksaan endoskopi.