Ada banyak penyebab kembung di pagi hari. Pertama-tama, hal ini dianggap terkait dengan pola makan, seperti makan terlalu banyak saat makan malam, pencernaan yang buruk, adanya sisa tinja di usus atau sisa makanan di saluran pencernaan, yang dapat menyebabkan kembung di pagi hari, tetapi ini biasanya akan berkurang setelah buang air besar di pagi hari. Kedua, mungkin ada disfungsi gastrointestinal atau diskinesia gastrointestinal. Dalam hal ini, adalah umum untuk memperbaiki perut kembung dengan bergerak atau menggosok perut setelah bangun tidur untuk meningkatkan motilitas gastrointestinal. Sebagian pasien mungkin juga memiliki penyakit gastrointestinal kronis, seperti gastroenteritis kronis, polip gastrointestinal, tumor gastrointestinal, dll. Selain itu, ada beberapa pasien yang menderita kelainan sensorik subjektif yang disebabkan oleh faktor psikosomatik. Pasien-pasien ini biasanya tidak memiliki lesi organik, tetapi menderita ketidaknyamanan yang disebabkan oleh tekanan kerja atau kehidupan yang penuh tekanan dan beban psikosomatik yang berat yang mengganggu saraf gastrointestinal normal. Singkatnya, meskipun ada berbagai alasan untuk bangun di pagi hari dengan perut kembung, selama tidak ada patologi organik, biasanya akan membaik secara signifikan selama kebiasaan makan dan hidup yang baik dipraktikkan. Jika gejalanya menetap, gastroskopi harus dilakukan untuk lebih memperjelas diagnosis dan pengobatan.