Penyakit jantung bawaan dapat diobati. Pengobatan yang umum digunakan hanya dapat meringankan beberapa gejala penyakit jantung bawaan dan memperlambat perkembangan penyakit. Namun demikian, sebagian besar pasien dengan penyakit jantung bawaan dapat disembuhkan dengan perawatan bedah atau intervensi pada waktu yang terbaik; beberapa pasien dengan penyakit jantung bawaan yang kompleks hanya dapat diobati secara paliatif dan tidak dapat mencapai koreksi fisiologis yang lengkap.