Secara umum, cacat septum atrium, cacat septum ventrikel kecil, duktus arteriosus paten, dan stenosis arteri pulmonalis ringan tidak memengaruhi pertumbuhan dan perkembangan, tetapi cacat septum ventrikel besar, duktus arteriosus paten, stenosis katup pulmonal yang parah, tetralogi Fallot, transposisi arteri besar, defek bantalan endokard, drainase vena pulmonalis ektopik lengkap, dan penyakit jantung kongenital sianotik lainnya dapat memengaruhi pertumbuhan dan perkembangan anak dengan derajat yang berbeda-beda. Pada prinsipnya, penyakit jantung bawaan harus dioperasi segera setelah terdeteksi. Namun demikian, semakin muda usia anak, semakin besar risiko pembedahan. Untuk alasan ini, defek septum atrium sederhana, defek septum ventrikel, stenosis pulmonal dan duktus arteriosus paten paling baik dioperasi antara usia 3 dan 6 tahun jika tidak ada hipertensi pulmonal yang signifikan. Pada saat ini, anak lebih berat, operasi lebih mudah dilakukan dan investigasi serta perawatan pra-operasi dan pasca-operasi dikelola lebih baik daripada pada anak-anak kecil. Namun demikian, dalam kasus defek septum ventrikel besar dan duktus arteriosus pulmonalis, pembedahan harus dilakukan sedini mungkin untuk mencegah perkembangan sindrom Eisenmenger, “pirau kanan-ke-kiri”, yang dapat menyebabkan hipertensi pulmonal yang berlebihan. Pada anak-anak dengan sianosis parah seperti tetralogi Fallot, karena penyakit ini memengaruhi pertumbuhan dan perkembangan mereka, atau seiring bertambahnya usia mereka, perubahan sekunder pada jantung meningkat secara signifikan, yang merugikan pembedahan dan pemulihan pasca-operasi, sehingga pembedahan dini dianjurkan. Dalam kasus luar biasa, waktu pembedahan harus diputuskan oleh dokter bedah, tergantung pada kondisinya.