Fungsi kekebalan tubuh anak-anak dengan penyakit jantung prekoks telah mendapat perhatian yang semakin meningkat dalam beberapa tahun terakhir, tetapi hasilnya tidak konsisten, dan beberapa bahkan bertentangan. Beberapa artikel menunjukkan bahwa anak-anak dengan shunt kiri ke kanan memiliki IgG dan IgA yang lebih rendah, CD4 yang lebih rendah dan CD8 yang lebih tinggi, dan rasio CD4/CD8 yang lebih rendah, yang menunjukkan adanya hipoimunitas dan disregulasi kekebalan tubuh. Peran penting IgA sekretori (SIgA) pada permukaan mukosa saluran pernapasan dan pencernaan sudah diketahui. Penelitian telah menunjukkan bahwa meskipun tidak ada hubungan langsung antara IgA serum dan SIgA, pengamatan jangka panjang menunjukkan bahwa IgA serum pasti kurang ketika SlgA kurang, sehingga pengukuran IgA serum dapat mencerminkan kadar SIgA. Disarankan bahwa kurangnya SIgA dalam saluran pernapasan kelompok anak-anak ini berarti bahwa SIgA tidak dapat secara efektif melindungi selaput lendir, yang mengarah ke berbagai serangan mikroba dan membuat mereka lebih rentan terhadap infeksi pernapasan dan bahkan pneumonia daripada kelompok kontrol anak-anak. IgG adalah imunoglobulin utama yang membunuh bakteri dan menetralkan virus dan racun. Rendahnya tingkat IgG pada kelompok predileksi konsisten dengan pengamatan klinis kami bahwa pneumonia pada anak-anak tidak mudah dikendalikan. Subset sel-T dibagi menjadi limfosit penolong (CD4) dan limfosit penekan (CD8), yang memiliki peran dalam meningkatkan atau menekan imunitas dari subset yang berbeda dari limfosit-T efektor dan limfosit-B, masing-masing, dan di bawah kondisi fisiologis, kedua sel yang berbeda secara fungsional ini tetap dalam keseimbangan relatif. Telah ditunjukkan bahwa terdapat disregulasi kekebalan tubuh dan fungsi kekebalan seluler yang rendah pada kelompok dengan penyakit jantung prekoks, jadi ini mungkin menjadi alasan lain mengapa anak-anak dengan penyakit jantung prekoks shunt kiri-ke-kanan rentan terhadap infeksi. Signifikansi disregulasi kekebalan tubuh ini dalam perkembangan dan perkembangan penyakit perlu diselidiki lebih lanjut. Pertumbuhan dan perkembangan semua jaringan dan organ pada anak-anak dengan penyakit jantung dini dipengaruhi sampai batas tertentu, dan disfungsi kekebalan tubuh adalah bagian dari keterlambatan perkembangan umum. Beberapa dokter telah menyarankan bahwa imunoglobulin dan subset sel-T harus secara rutin diuji pada anak-anak dengan shunt kiri-ke-kanan untuk memahami fungsi kekebalan tubuh mereka dan untuk memandu tindakan klinis.