Otitis media supuratif kronis sering kali disebabkan oleh infeksi berulang dari otitis media supuratif akut, tetapi ada juga faktor lain, seperti radang kronis pada hidung dan faring, kehilangan daya tahan tubuh secara umum atau lokal, malnutrisi, anemia, dan lain-lain. Agen penyebab yang umum adalah Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa dan Aspergillus. Seiring dengan perkembangan penyakit, jenisnya menjadi lebih kompleks. Misalnya, spesies jamur atau spesies yang kebal obat. Oleh karena itu, antibiotik dan obat tetes telinga dapat meringankan gejala otitis media supuratif kronis selama serangan akut, tetapi tidak menyelesaikan masalah yang mendasarinya.