Reaksi gastrointestinal yang berhubungan dengan diet terutama disebabkan oleh iritasi makanan pada mekanoreseptor usus, kemoreseptor (misalnya capsaicin), atau perubahan transportasi gastrointestinal, tekanan osmotik atau sekresi. Mekanisme spesifiknya adalah sebagai berikut: i. Alergi makanan Menurut statistik, 1-4% dari populasi Amerika memiliki alergi makanan. Mekanisme alergi makanan dapat dibagi menjadi dimediasi IgE (hipersensitivitas tipe 1) dan tidak dimediasi IgE. Reaksi alergi yang dimediasi IgE memiliki onset akut dan paling sering terjadi pada makanan seperti kacang, kacang-kacangan, telur, susu, kedelai, ikan, kerang, stroberi dan gandum. Reaksi alergi yang paling umum adalah urtikaria akut dan reaksi gastrointestinal yang umum termasuk mual, disfagia, sakit perut, muntah dan diare. Tes tusuk kulit lebih berharga daripada tes adsorpsi radioallergen untuk diagnosis reaksi hipersensitivitas IgE. Reaksi hipersensitivitas yang tidak dimediasi IgE dimediasi oleh sel Th2 dan memiliki onset yang lambat, dengan gejala terbatas pada saluran pencernaan. II. Intoleransi makanan Intoleransi makanan mencerminkan respons non-kekebalan terhadap berbagai proses penyakit, termasuk sensitivitas gluten non-celiac (NCGS), efek komponen kimia dalam makanan (misalnya histamin, glutamat, kafein), kekurangan enzim (misalnya laktase), gangguan transportasi (misalnya fruktosa), dan efek karbohidrat rantai pendek dalam makanan. Secara khusus, intoleransi makanan terdapat pada 50-70% pasien IBS dan secara serius mempengaruhi kualitas hidup pasien. Gejala gastrointestinal yang disebabkan oleh makanan sangat lazim terjadi pada wanita. Makanan intoleran yang umum termasuk: diet tinggi karbohidrat, kopi, alkohol, susu, cokelat, kacang-kacangan, bawang bombay, kubis, dan makanan tinggi lemak dan rempah-rempah. Ketiga, defisiensi laktase adalah defisiensi enzim yang paling erat kaitannya dengan intoleransi makanan. Fruktosa adalah monosakarida yang sering menyebabkan ketidaknyamanan perut pada penderita IBS. Penyerapan fruktosa dalam usus halus rendah karena terbatasnya jumlah transporter fruktosa GLUT-5 dalam sel epitel usus halus. Fruktosa yang tidak terserap mempercepat motilitas usus dan meningkatkan produksi gas usus, dengan 50% sukarelawan sehat mengalami malabsorpsi fruktosa setelah 25 g fruktosa dan hingga 75% setelah 50 g fruktosa. Karbohidrat rantai pendek, biasanya ditemukan dalam sereal, buah-buahan, sayuran, kacang-kacangan dan kacang-kacangan, termasuk fruktan, oligogalaktan (galaktosom) dan poliol. Zat-zat ini sulit diserap dalam usus halus dan dapat meningkatkan tekanan osmotik dalam usus besar dan menyebabkan fermentasi oleh bakteri kolon, yang menyebabkan ketidaknyamanan gastrointestinal. Fermentasi bakteri kolon pada gilirannya dapat menghasilkan hidrogen, metana, karbon dioksida dan asam lemak rantai pendek. IV. Osmolalitas usus yang berubah adalah mekanisme patogenik potensial untuk gejala IBS yang berhubungan dengan pola makan dan terlihat pada pasien dengan IBS diare (IBS-D). Beberapa penelitian telah menemukan bahwa kerusakan epitel mukosa usus mikroskopis, hiperplasia limfositik intraepitelial dan pelebaran celah vili lebih sering terjadi pada pasien yang mengonsumsi gandum, kedelai, susu dan ragi. V. Hipersensitivitas visceral Pasien dengan penyakit usus mungkin memiliki toleransi yang lebih rendah terhadap makanan tertentu (misalnya capsaicin) dibandingkan populasi normal dibandingkan populasi sehat. Gejala klinis SIBO tidak spesifik dan mirip dengan gejala intoleransi makanan dan gangguan mikroekologi usus. Tidak ada standar emas praktis untuk pengujian. VII. Mikroekologi usus Perubahan lingkungan mikrobiologi usus yang disebabkan oleh diet yang tidak terkontrol dapat menyebabkan gejala klinis diare, kembung, konstipasi, dan manifestasi lain yang berbeda.