Flu gastrointestinal terutama disebabkan oleh virus yang disebut “coxsackie” dan dapat disertai dengan kombinasi infeksi bakteri. Gejala-gejalanya adalah: kembung, sakit perut, muntah, diare, buang air besar berkali-kali dalam sehari, perasaan lemah dan, dalam kasus yang parah, dehidrasi dan gangguan elektrolit. Fokus utamanya adalah untuk rehidrasi, menghentikan diare dan menjaga keseimbangan elektrolit. Jika dehidrasi parah sudah terjadi, rehidrasi intravena dapat diberikan. Jika terjadi muntah berulang meskipun sudah berpuasa dan dehidrasi, maka diperlukan penanganan simtomatik lebih lanjut seperti proteksi lambung dan terapi anti-emetik. Untuk diare parah, obat antidiare seperti montelukast, butiran dekadron, kapsul Bacillus cereus dan ragi tanin dapat diberikan. Pengobatan suportif simtomatik seperti acetaminophen dan ibuprofen juga harus diberikan untuk mengurangi demam dan pendinginan fisik. Anak-anak yang menderita pilek gastrointestinal juga dapat diobati dengan herbal yang meredakan stagnasi, seperti Gao Wei Bao He Wan dan Zhu Pu Monkey Date San. Jika anak menderita perut kembung, sakit perut, dan muntah-muntah, ia dapat meminum cairan oral Si Mo Tang untuk menghentikan muntah dan menghilangkan makanan, kemudian meminum obat lain sekitar setengah jam kemudian. Tetapi dalam kedua kasus tersebut, jika gejala-gejala bayi tidak berkurang, maka tetap penting untuk secara aktif mencari pertolongan medis dan meminta dokter memutuskan metode pengobatannya.