Amenore hipotalamus (HA), jenis amenore sekunder yang paling umum, disebabkan oleh sekresi hormon pelepas gonadotrofin (GnRH) yang tidak adekuat dari sel-sel neuroendokrin hipotalamus karena berbagai patologi dalam sistem saraf pusat di atas tingkat hipofisis dan di hipotalamus. Ini termasuk amenorea hipotalamus fungsional, gangguan hipotalamus organik dan obat-obatan tertentu yang mengganggu poros hipotalamus-hipofisis-ovarium (poros H-P-O). Apa yang umumnya disebut sebagai amenore hipotalamus adalah amenore hipotalamus fungsional. Ini adalah amenorea reversibel yang terutama ditandai dengan penurunan sekresi GnRH dari hipotalamus (termasuk frekuensi dan amplitudo sekresi pulsatile), tetapi tanpa lesi organik di kelenjar sentral atau endokrin. Amenorea hipotalamus adalah diagnosis eksklusi, yang membutuhkan pengecualian kemungkinan penyebab lain dari amenorea sentral atau penyakit organik. Hipotalamus adalah organ reproduksi yang penting, mengatur fungsi kelenjar hipofisis melalui konduksi saraf dan sistem hipofisis-portal, menyebabkan kelenjar hipofisis mensekresikan hormon yang sesuai, yang bekerja pada ovarium untuk menghasilkan hormon steroid dan memastikan pemeliharaan normal fungsi reproduksi. Hipotalamus menerima rangsangan dari sel saraf pusat untuk mengatur sekresi hormon hipofisis dan diatur oleh umpan balik negatif dari hormon yang disekresikan oleh kelenjar hipofisis. Sel-sel neuroendokrin dalam nukleus arkuata hipotalamus sentral berfungsi dengan melepaskan GnRH secara pulsatile. Ada banyak penyebab disfungsi hipotalamus, seperti rangsangan mental, kesedihan dan kekhawatiran, rasa takut dan cemas, stres dan pengerahan tenaga, serta perubahan lingkungan, rangsangan dingin, dan olahraga berat. Semua ini dapat menyebabkan kelainan pada sekresi GnRH, yang menyebabkan non-ovulasi dan amenorea. Dalam pengobatan amenorea hipotalamus, hal yang utama adalah menemukan dan menghilangkan stresor, mengatur ketegangan mental, terutama pada remaja putri yang berada dalam fase revisi ujian sekolah menengah yang penuh tekanan; makan makanan yang seimbang, kurangi olahraga berat, dan kembalikan berat badan. Setelah penyesuaian gaya hidup, sekitar 80% pasien dapat melanjutkan menstruasi normal. Langkah selanjutnya adalah memberikan terapi penggantian hormon, seperti Clomid dan Fentanyl, dengan berbagai obat yang bisa dipilih. Kesimpulannya, amenorea selama masa remaja perlu mendapat perhatian dan perlu diobati sejak dini. Jika pengobatan ditunda, maka akan mempengaruhi perkembangan dan fungsi reproduksi remaja putri, dan hipoestrogenemia amenorea akan dengan mudah menyebabkan keropos tulang dan berkembang menjadi osteoporosis, serta membawa risiko penyakit kardiovaskular.