Indikasi untuk transplantasi paru-paru: fibrosis paru idiopatik, fibrosis paru kistik, hipertensi paru primer, emfisema, emfisema defisiensi alfa-1 antitripsin, penyakit paru stadium akhir, tidak ada penyakit arteri koroner, fungsi hati dan ginjal yang normal, fungsi jantung kiri normal, fungsi jantung kanan normal, fraksi ejeksi >25%, tidak ada kontraindikasi terhadap imunosupresi, secara psikologis stabil, tidak memiliki riwayat merokok atau alkohol, tidak memiliki riwayat penyalahgunaan obat, tidak memiliki riwayat gangguan kejiwaan, tidak obesitas, hormon (prednison) <20mg setiap hari, penerima transplantasi paru tunggal <60 tahun, penerima transplantasi paru ganda <50 tahun. Kontraindikasi absolut untuk penerima transplantasi paru adalah: penerima transplantasi paru tunggal >65 tahun, penerima transplantasi paru ganda >60 tahun, infeksi sistemik aktif, penyakit sistemik ekstra-paru yang signifikan yang menyebabkan kelangsungan hidup terbatas, fraksi ejeksi jantung kiri <35%, dekompensasi hati atau ginjal yang tidak dapat disembuhkan, keganasan yang progresif, penyakit serebrovaskular, trombosis vena, hipertensi yang tidak dapat dikontrol, tukak lambung yang aktif, AIDS, tidak dapat disembuhkan koagulopati, gangguan neuromuskuloskeletal yang membatasi kebebasan dari tempat tidur, dan pasien serta keluarga yang tidak kooperatif. Kontraindikasi relatif meliputi: penyakit mental, infeksi paru, pasien yang menggunakan ventilator, cachexia, berat badan di atas yang diharapkan ± 10%, pemulihan yang buruk, perokok, pengguna hormon, pembedahan dada atau perut sebelumnya. Kontraindikasi untuk donor transplantasi paru: usia >50 tahun, riwayat penyakit paru primer dan pembedahan dada sebelumnya, antigen permukaan hepatitis B positif, HIV positif, infeksi sifilis dan toksoplasma.