Sakit kepala cluster memiliki gejala yang kuat dan umumnya mencakup pengobatan pada fase onset dan pengobatan pencegahan pada fase remisi.
Pengobatan selama fase onset umumnya merupakan cara yang paling efisien untuk meredakan gejala melalui obat-obatan seperti agonis reseptor 5-H1B / 1D selektif dalam hubungannya dengan oksigenasi.
Pasien dalam remisi sebagian besar bebas dari gejala sakit kepala dan dapat diobati secara profilaksis dengan garam lithium dan melatonin. Jika semua efek terbatas, perawatan bedah, seperti perawatan dengan operasi ganglion trigeminal atau pterygopalatine, stimulasi saraf oksipital, dan terapi stimulasi otak dalam, dapat dipertimbangkan.