Komplikasi dapat terjadi pada 40% hemangioma dan bervariasi, tergantung dari lokasi, ukuran dan tingkat pertumbuhan hemangioma. Komplikasi dapat bersifat fungsional atau organik dan umumnya meliputi ulserasi, perdarahan, infeksi, gagal jantung, gangguan penglihatan, sumbatan jalan napas, kesulitan makan, dan penyumbatan liang telinga luar. Bisul adalah komplikasi hemangioma yang paling umum terjadi, diikuti dengan perdarahan. Bisul sering terjadi selama masa pertumbuhan dan lebih sering terjadi di daerah yang rawan gesekan. Bisul terasa nyeri dan dapat terinfeksi serta mengalami perdarahan, yang pada akhirnya akan sembuh dengan jaringan parut. Perdarahan biasanya disebabkan oleh kebocoran vena akibat peningkatan tekanan lokal, tetapi gangguan koagulasi sistemik atau malformasi arteriovenosa perlu disingkirkan. Infeksi juga merupakan komplikasi umum dari hemangioma infantil. Infeksi bersifat primer di satu sisi, tetapi lebih sering sekunder akibat ulserasi, dan lebih sering terjadi di daerah yang sulit dirawat seperti mulut dan daerah perianal. Hemangioma campuran dapat menyebabkan penyumbatan pembuluh darah besar, yang dapat menyebabkan gagal jantung. Hemangioma di sekitar mata dapat menyebabkan astigmatisme, ptosis, strabismus, kelainan refraksi, proptosis, ambliopia, dan kebutaan. Hemangioma di leher atau bagian bawah wajah dapat dikaitkan dengan hemangioma subglotis, yang menyebabkan sumbatan jalan napas, yang dapat cukup parah hingga menyebabkan kematian. Hemangioma di dalam mulut atau rongga hidung dapat menyebabkan kesulitan makan. Hemangioma di telinga dapat menyebabkan obstruksi saluran pendengaran eksternal, yang dapat memengaruhi pendengaran dalam jangka pendek, tetapi hanya sedikit berpengaruh pada pendengaran dalam jangka panjang. Pertumbuhan berlebih dari hemangioma infantil raksasa pada wajah dapat menyerang tulang wajah atau tulang rawan telinga.