Efek dari beberapa obat yang umum digunakan pada kesuburan mudah terabaikan. Beberapa obat yang digunakan setiap hari dapat menghambat kelangsungan hidup sperma atau bahkan menyebabkan kurangnya produksi sperma, selain memengaruhi pematangan, motilitas, dan morfologi sperma. Efek obat-obatan ini dapat dipulihkan secara bertahap seiring dengan dihentikannya penggunaan obat atau seiring dengan berjalannya waktu, tetapi efek beberapa obat dapat bersifat permanen. Ada empat cara di mana obat-obatan dapat memengaruhi kesuburan pria: pertama, dengan bekerja secara langsung pada gonad pria, memengaruhi fungsi sel spermatogenik penghasil sperma pada testis dan sejenis sel di dalam testis yang disebut sel Leydig; kedua, dengan bekerja pada poros hipotalamus-hipofisis-gonad, memengaruhi sekresi normal hormon dalam tubuh yang menyebabkan perubahan kadar gonadotropin dan testosteron, yang pada akhirnya memengaruhi kesuburan; ketiga, dengan mengganggu fungsi ejakulasi Ketiga, merusak fungsi ejakulasi dan fungsi ereksi penis, sehingga air mani tidak dapat masuk ke dalam tubuh pasangan, sehingga menyebabkan gangguan sperma. Keempat, dapat berdampak negatif pada libido pria, yang mengakibatkan kurangnya kehidupan seksual yang normal di antara pasangan. Ada beberapa jenis obat yang dapat mempengaruhi kesuburan: i. Obat kemoterapi; pengaruh obat kemoterapi terhadap kesuburan berkaitan dengan jenis obat kemoterapi, dosis dan lama penggunaan obat. Obat kemoterapi yang umumnya mempengaruhi kesuburan antara lain: Adriamisin, Trimetoprim, Vinkristin, Azulfidin, Azacitidin, Vinkristin Sulfat, Prokarbazin Hidroklorida, Cisplatin, Etoposida, dan lain-lain. Sebagian besar obat tekanan darah berpengaruh pada kesuburan dengan mengganggu fungsi seksual. Beberapa diuretik dapat menyebabkan disfungsi ereksi dengan mengurangi resistensi pembuluh darah dan dengan demikian menyebabkan suplai darah yang tidak memadai ke penis. Antiseptik dapat mempengaruhi kesuburan dengan cara mempengaruhi fungsi ereksi dan libido serta efek potensial pada kualitas air mani. Penghambat saluran kalsium dapat menghambat proses pembuahan yang normal. Penggunaan obat anti androgenik juga dapat menyebabkan masalah kesuburan karena dapat mempengaruhi fungsi fisiologis normal androgen dalam tubuh (penurunan libido dan gangguan produksi sperma). Steroid anabolik semakin banyak disalahgunakan oleh para atlet. Penggunaan androgen anabolik dalam jumlah besar dapat menyebabkan hipogonadisme dengan gonadotropin yang rendah. Dalam kebanyakan kasus, fungsi gonad normal dapat dipulihkan setelah penghentian obat. Keempat, obat lain; beberapa obat yang umum digunakan seperti neomisin, eritromisin, dan gentamisin dapat menyebabkan penurunan kualitas air mani. Imunosupresan yang digunakan pada pasien transplantasi organ seperti: siklosporin, juga dapat menyebabkan penurunan kepadatan dan viabilitas sperma. Colchicine dan allopurinol, yang digunakan untuk mengobati asam urat, juga memiliki efek buruk pada kesuburan pria. Furacilin, simetidin, salbutamol, kokain, nikotin, dan ganja dapat mengganggu spermatogenesis. Namun, spermatogenesis dan/atau fungsi sperma dapat kembali normal setelah penghentian obat. Paparan terhadap racun lingkungan seperti pestisida juga harus diperhatikan.