Tergantung pada kondisi pasien, tersedia pilihan berikut ini: 1) hepatektomi; 2) kistektomi; 3) pembukaan kista atau eksisi kista mayor; 4) drainase internal kista; 5) tusukan kista dan aspirasi cairan dan sklerosis. Jika terjadi komplikasi seperti kista pecah, torsi kistik atau perdarahan intrakapsular, selain operasi darurat, diperlukan operasi elektif tergantung pada ukuran dan lokasi kista dan kondisi umum pasien dan gejala yang disadari, dan pengamatan rutin menggunakan ultrasonografi, yang memerlukan kewaspadaan terhadap terjadinya perubahan ganas. Hati polikistik biasanya harus diobati tanpa pembedahan, karena lesinya melibatkan seluruh hati, penyakit ini tidak dapat disembuhkan kecuali jika menggunakan transplantasi hati. Namun, pembedahan harus dipertimbangkan untuk mengurangi tekanan setelah hepatomegali menekan dada dan perut dan mempengaruhi sirkulasi pernapasan. Pembedahan untuk hati polikistik: Kecuali jika lesi terbatas pada satu lobus hati dan bergejala; atau jika dicurigai adanya keganasan, pembedahan umumnya tidak dianjurkan. Pada hati polikistik, ketika kista individu ditemukan dengan cepat membesar dan menekan organ yang berdekatan, secara serius mempengaruhi kehidupan sehari-hari pasien atau fungsi kardiopulmoner, tusukan berulang dan aspirasi dapat dilakukan pada kista yang lebih besar. Jika pasien dalam kondisi umum yang baik dan memiliki fungsi hati yang normal, operasi hati terbuka juga dapat dilakukan untuk mengurangi tekanan, meringankan gejala, dan mendorong regenerasi sel hati. Jika memungkinkan, transplantasi hati dapat dilakukan untuk menyembuhkan penyakit sepenuhnya. Pengobatan hati polikistik dikombinasikan dengan ginjal polikistik: Ini termasuk tusukan atau sayatan kista untuk mengurangi tekanan kista, yang kadang-kadang dapat menunda perkembangan lesi dan gagal ginjal, dan terapi dialisis jika perlu. Penyembuhan radikal memerlukan transplantasi ginjal.