Anak-anak dengan penyakit jantung bawaan bisa memiliki anak setelah operasi untuk memperbaiki kelainan bentuknya. Pertama, penyakit jantung adalah gangguan peredaran darah, sedangkan kesuburan adalah gangguan reproduksi, dan selama sistem reproduksinya sehat, anak-anak dapat dilahirkan selama fungsi jantung mereka memungkinkan. Kedua, penyakit jantung bawaan adalah kelainan genetik poligenik dan sekarang sudah diterima bahwa penyakit jantung bawaan disebabkan oleh faktor genetik atau lingkungan atau kombinasi keduanya, dengan yang terakhir ini menjadi yang paling penting. Oleh karena itu, anak yang kelak lahir dari ibu atau ayah yang menderita penyakit jantung bawaan, belum tentu memiliki penyakit tersebut, walaupun, tentu saja, semua orang yang menderita penyakit jantung bawaan, berharap memiliki anak yang sehat, ketika mereka menjadi orang tua. Cara terbaik untuk melakukan hal ini adalah dengan melakukan skrining pra-nikah dan konseling genetik sebelum menikah. Orang tua dengan penyakit jantung bawaan dapat melakukan tes kromosom sebelum menikah untuk menyingkirkan faktor genetik, pergi ke spesialis jantung untuk melakukan tinjauan USG jantung dan menilai kesesuaian fungsi jantung untuk persalinan dan jenis metode persalinan, dan mendengarkan saran dari spesialis tergantung pada jenis penyakitnya. Jika seorang ibu yang telah menjalani penggantian katup menggunakan antikoagulan oral, rejimen pengobatan harus disesuaikan selama kehamilan. Pemeriksaan ultrasonografi jantung selama periode janin juga dapat mendeteksi penyakit jantung bawaan yang serius pada waktunya untuk deteksi dan pengobatan dini.