Hipotermia fungsional adalah ketika tubuh dalam keadaan demam rendah tanpa adanya patologi organik. Biasanya, wanita mengalami hipotermia fungsional setelah ovulasi. Anak-anak dengan metabolisme yang cepat mungkin mengalami hipotermia fungsional setelah beraktivitas. Selain itu, beberapa pasien dengan hipertiroidisme dan metabolisme yang cepat juga dapat mengalami hipotermia fungsional.