Gejala yang paling menonjol adalah nyeri ulu hati dan refluks asam, yang derajatnya bervariasi dari orang ke orang, dan kemunculannya tergantung pada patogenesisnya. Refluks gastro-esofagus terutama disebabkan oleh tiga faktor: 1) gerakan peristaltik esofagus dan berkurangnya kemampuan untuk membersihkannya; 2) relaksasi sfingter kardia bagian bawah; 3) retensi lambung, obstruksi pengosongan lambung dan perlambatan pengosongan. Ketiga faktor inilah yang menyebabkan retensi isi lambung, menyebabkan peningkatan sekresi asam lambung dan bahkan refluks empedu dan mulas.