Awalnya diisolasi dari jaringan kanker serviks, SCC adalah inhibitor protease serin dan penanda tumor yang sangat spesifik yang digunakan terutama untuk diagnosis karsinoma skuamosa. SCC didistribusikan dalam sel epitel skuamosa dalam jaringan normal di seluruh tubuh dan oleh karena itu darah perifer normal mengandung berbagai tingkat SCC. Namun, karena sel epitel skuamosa berproliferasi secara ganas, SCC intraseluler dengan cepat dilepaskan ke dalam darah, yang menyebabkan peningkatan SCC darah perifer. Oleh karena itu, SCC menarik untuk diagnosis dan pemantauan semua kanker asal sel epitel skuamosa. Contohnya termasuk: karsinoma skuamosa serviks, karsinoma skuamosa paru-paru, karsinoma skuamosa esofagus, karsinoma skuamosa rongga mulut, nasofaring, kandung kemih, saluran anal, kulit, dll. Untuk tumor-tumor di atas yang telah terdeteksi, perubahan konsentrasi SCC sangat erat kaitannya dengan kemanjuran pengobatannya, kekambuhan, metastasis dan perkembangan penyakitnya, dan penilaian prognosisnya: kadar SCC klinis yang tinggi secara abnormal harus ditanggapi secara serius dan diwaspadai terjadinya tumor-tumor di atas: begitu kadar SCC yang tinggi secara abnormal terjadi, pertama-tama, pengambilan sampel darah berulang diperlukan sebelum peninjauan lebih lanjut untuk mengecualikan hasil dari kesalahan laboratorium: jika masih tinggi, maka Jika tingkat SCC masih tinggi, pemeriksaan fisik komprehensif lebih lanjut dan studi pencitraan seperti CT dada, perut dan panggul yang ditingkatkan diperlukan. SCC yang tinggi secara abnormal sering kali mengindikasikan adanya lesi, yang dapat dideteksi sedini mungkin dengan PET-CT. Deteksi dini dan pengobatan dini akan menghasilkan hasil yang lebih baik. Secara klinis, SCC dapat mendahului tanda dan gejala selama beberapa bulan, jadi penting untuk memantau perubahan SCC secara ketat, bahkan jika tidak ada kelainan yang terdeteksi pada pencitraan: SCC hanya menunjukkan risiko karsinoma skuamosa dalam tubuh, dan konfirmasi lebih lanjut dari diagnosis diperlukan, yang membutuhkan pencitraan dan patologi. SCC juga penting secara klinis dalam memantau kekambuhan tumor.