Gejala utama disfungsi gastrointestinal selama menopause meliputi perut kembung dan nyeri, mual, muntah dan buang air besar yang tidak teratur. Gejala disfungsi gastrointestinal disebabkan oleh berkurangnya efisiensi jaringan gastrointestinal, retensi makanan yang berkepanjangan dalam saluran gastrointestinal, reaksi metabolik dengan flora berbahaya yang tumbuh terlalu banyak, dan produksi zat gas dalam jumlah besar, seperti karbon dioksida dan amonia. Dilatasi paksa mukosa superfisial rongga gastrointestinal menyebabkan pasien menunjukkan gejala seperti distensi abdomen dan nyeri. Sebagian zat dalam rongga pencernaan akan dimuntahkan kembali ke dada dan esofagus sebagai respons terhadap pengosongan, sehingga menimbulkan gejala seperti refleks mual dan muntah. Karena disfungsi peristaltik, metabolit dalam tubuh tidak dapat mencapai saluran pencernaan bagian bawah seperti kolon sigmoid dan usus besar dengan cepat dan lancar, sehingga pasien dengan kondisi ini akan memiliki gejala sekunder seperti tinja kering dan buang air besar yang buruk.