Omeprazol tidak cocok untuk digunakan dalam kasus flokulasi gastrointestinal. Karena omeprazol adalah inhibitor pompa proton, tindakan utamanya adalah mengurangi efek iritasi pada jaringan lambung yang rusak dengan menghambat sekresi asam lambung. Namun demikian, obat ini juga menghambat pepsin, lipase, amilase dan enzim pencernaan lainnya, yang dapat memperburuk gejala gangguan pencernaan, seperti kehilangan nafsu makan dan malnutrisi. Pasien dengan disfungsi gastrointestinal dapat diobati dengan kombinasi probiotik, stimulan gastrointestinal, dan obat-obatan Cina untuk pencernaan. Misalnya, kapsul triptans Bifidobacterium, tablet dispersible Mosapride sitrat Mosapride, dan Cairan Oral Gastrointestinal. Jenis obat di atas tidak hanya dapat dengan cepat memperbaiki disbiosis flora internal saluran pencernaan, tetapi juga meningkatkan fungsi peristaltik saluran pencernaan dan memperbaiki gejala-gejala yang merugikan seperti kembung dan nyeri, refluks asam, mual dan buang air besar tidak teratur.