Penelitian cross-sectional telah menunjukkan bahwa kebersihan mulut yang buruk, riwayat periodontitis, merokok dan riwayat diabetes merupakan faktor risiko peri-implantitis. Akumulasi kelas bakteri pada permukaan restorasi implan gigi menyebabkan peradangan mukosa, mukosa tersumbat, kemerahan, bengkak dan tumpahan nanah, yang jika tidak diatasi dapat menyebabkan resorpsi tulang, dan penelitian telah melaporkan bahwa risiko penyakit peri-implan 13 kali lebih tinggi pada pasien yang memiliki kebersihan mulut yang buruk dibandingkan dengan pasien yang memiliki kebersihan mulut yang baik. Pasien dengan periodontitis memiliki risiko yang lebih tinggi untuk mengalami penyakit peri-implan dan pasien yang telah kehilangan gigi karena periodontitis dan melakukan restorasi implan memiliki risiko yang lebih tinggi untuk mengalami kegagalan implan dibandingkan dengan pasien yang kehilangan gigi karena alasan lain. Pasien dengan riwayat perawatan periodontitis memiliki tingkat kegagalan implan gigi sebesar 10% setelah 10 tahun, dibandingkan dengan tingkat kegagalan 4% untuk pasien yang kehilangan gigi bukan karena periodontitis. Menurut Survei Epidemiologi China ke-3, populasi Cina memiliki kebersihan mulut yang buruk, dengan 93% populasi membutuhkan pembersihan dan prevalensi penyakit periodontal yang tinggi, 97,3% pada kelompok usia 65-74 tahun dan 99,4% pada kelompok usia 65-74 tahun. Risiko kegagalan implan gigi mungkin lebih tinggi di lingkungan dengan kebersihan mulut yang buruk di Cina, tetapi hanya sedikit penelitian yang telah dilaporkan mengenai kejadian, etiologi, diagnosis dan pengobatan penyakit peri-implan pada populasi Cina. Pasien implan yang merokok memiliki indeks kelas bakteri yang lebih tinggi, poket yang lebih dalam, perdarahan poket, peradangan jaringan lunak dan resorpsi tulang dibandingkan yang tidak merokok. Diabetes dengan kontrol glukosa darah yang buruk terkait erat dengan peri-implantitis, dengan kejadian mukositis dan peri-implantitis pada pasien diabetes masing-masing sebesar 64,6% dan 8,9%. Respon kekebalan tubuh seseorang terhadap infeksi berperan dalam resorpsi tulang dan beberapa pasien bereaksi berlebihan terhadap infeksi dengan memproduksi sitokin antiinflamasi dalam jumlah yang berlebihan seperti interleukin 1β (IL-1β), interleukin 6 (IL-6) atau tumor necrosis factor alpha (TNF-α), yang menyebabkan kerusakan jaringan yang berlebihan. Peningkatan kadar sitokin anti-inflamasi IL-1β dalam cairan sulkus gingiva peri-implan dapat mengindikasikan adanya penyakit yang aktif. Identifikasi gen yang mengontrol atau mengatur respon inang dapat menjadi sarana untuk mengevaluasi risiko infeksi peri-implan, tetapi aspek ini masih kurang dipahami. Selain itu, faktor risiko yang terkait dengan penyakit peri-implan meliputi: osteoporosis, kebiasaan menggertakkan gigi di malam hari, dll. Faktor risiko lokal juga meliputi: morfologi permukaan implan (kekasaran), desain leher implan, lebar gingiva yang berkeratin, dll.