Bedah cacat septum dibagi menjadi oklusi intervensi dan bedah jantung terbuka, dan kedua prosedur bedah tersebut memiliki karakteristiknya masing-masing. Bedah penyumbatan defek septum intervensi: Prosedur invasif minimal menggunakan intervensi tusukan vena femoralis untuk perbaikan septum atrium, dengan keuntungan trauma yang lebih sedikit, pemulihan lebih cepat, dan tidak ada sayatan setelah operasi, dan kerugiannya prosedur harus dipandu oleh paparan radiasi. Sisi pertama blocker dibuka, dan sisi kedua dibuka setelah menarik kembali blocker ke defek septum atrium. Blocker kemudian dipisahkan dari perangkat pengiriman. Jantung selalu dalam keadaan berdetak selama prosedur, menghindari operasi jantung terbuka dan proses henti jantung ekstrakorporeal. Bedah dada terbuka untuk cacat septum atrium: Perbaikan cacat septum atrium dilakukan dengan dada terbuka di bawah sirkulasi ekstrakorporeal. Keuntungannya adalah, prosedur ini cocok untuk pasien yang tidak dapat menjalani pembedahan invasif minimal, dan bagian cacat yang berbeda serta malformasi intrakardiak gabungan lainnya dapat dikoreksi secara bersamaan. Kerugiannya adalah, prosedurnya lebih invasif dan pemulihannya lebih lambat. Insisi median sternal biasanya dibuat, dan sirkulasi ekstrakorporeal dibuat setelah insisi perikardium. Sirkulasi ekstrakorporeal adalah sirkulasi darah yang menggantikan fungsi jantung dan paru-paru dengan mesin jantung-paru buatan di luar tubuh. Setelah jantung berhenti berdetak, cacat septum ditutup dengan jahitan atau tambalan dan jantung kembali berdetak. Oklusi intervensi dan bedah jantung terbuka sesuai untuk kondisi yang berbeda, dan prosedur yang tepat yang digunakan tergantung pada tingkat keparahan kondisi pasien.