Mayoritas fistula ini memiliki kompleksitas yang tinggi. Selain bentuk fistula yang kompleks, perbedaan dalam organisasi fistula juga merupakan masalah penting dalam hal kemudahan pemulihan dari pengobatan. Dengan perkembangan teknologi pencitraan medis berteknologi tinggi, anatomi fistula anal yang kompleks menjadi semakin jelas dalam diagnosis pencitraan. USG 3D dan pencitraan resonansi magnetik 3D dapat dengan jelas menunjukkan bukaan internal fistula, bentuk fistula, adanya rongga kistik dan hubungan dengan sakro-tulang ekor dan rektum sebelum operasi, meletakkan dasar untuk pemberantasan fistula dengan satu kali operasi. Khususnya pada fistula kistogenik, ukuran dan jumlah rongga kistik menentukan rute dan rencana pembedahan.