Penyebab invaginasi puting meliputi dua penyebab utama berikut ini, sebagai berikut: 1. invaginasi puting bawaan: disebabkan oleh perkembangan bawaan, pemendekan saluran payudara, kontraktur fibrosis jaringan parsial, displasia otot polos puting susu; 2. invaginasi puting yang didapat: sebagian besar disebabkan oleh puting susu yang ditarik oleh jaringan patologis di payudara, sebagian besar karena peradangan, tumor, dan penyakit lainnya, yang menyerang saluran, ligamen, dan fasia payudara; 3. invaginasi puting yang didapat: sebagian besar disebabkan oleh puting yang ditarik oleh jaringan patologis di payudara, terutama karena peradangan, tumor dan penyakit lain, menyerang saluran, ligamen dan fasia payudara. Hal ini disebabkan oleh kontraksi saluran, ligamen dan fasia yang diserang.